Sydney Bristowová zjišťuje, že má poslední dva roky života vymazané z paměti...
Pozor následuje podrobný obsah včetně spoilerů
Sydney Bristowová se probudí v Hong Kongu a nepamatuje se na nic, co se s ní dělo. Je dopravena do centrály CIA a tam se dozví, že před dvěma roky bylo nalezeno, identifikováno a spáleno její mrtvé tělo. Svět kolem Sydney se změnil. Její přátelé zmizeli, Vaughn je ženatý, Sydneyin otec Jack je už rok ve vazbě. Ve vlaku do Paříže byl zavražděn kromě jiných cestujících i spolupracovník CIA Kingsley, který převážel mikročip s plány nového typu bezpilotního špionážního letounu. Podle CIA provedla tuto akci mezinárodní organizace Dohoda, která má novou základnu na pařížském předměstí. Sydney předstírá, že se jí vrátila paměť a sdělí CIA, že byla v minulých dvou letech zadržována právě Dohodou, mimo jiné i v její základně ve Francii. Doufá, že jí CIA vrátí prověření a pošle ji do akce. Tak by měla přístup i k osobním složkám a mohla by dostat svého otce z vazby. Sydney je skutečně poslána do Francie a má s malou skupinou zaútočit na základnu Dohody a zmocnit se čipu. Akce skončí naprostým nezdarem. Všichni agenti kromě Sydney a Weisse jsou zabiti. Sydney se rozhodne, že se nevrátí do CIA, ale bude pátrat dál na vlastní pěst.