Jednoho krásného rána se dr. Elizabeth Weirová probudí v psychiatrické léčebně na Zemi. Neví, jak se sem dostala a kde je zbytek jejího týmu z Atlantis. Je jí řečeno, že vše, co podle ní posledních pár let prožila, je jen výmysl její představivosti a fantazie. Atlantis nikdy neexistovala, nikdo neví nic ani o hvězdné bráně a cestování mezi planetami. Všechno je prý zapříčiněno nadměrným stresem a zhroucením Elizabeth. Je jen na ní, zda tomu uvěří nebo ne...