Nový velitel Richard Woolsey je transportován na Atlantidu a hned musí čelit novému problému - dr. Kellerová se nehlásí na své ranní směně. Teyla, McKay a dr. Beckett, který byl probuzen ze stáze, nalézají Jennifer v bezvědomí a s neznámými organickými končetinami přirostlými k jejímu tělu. Vypadá to jako nějaký další experiment Wraitha Michaela. Carson provádí lékařský výzkum, zatímco ostatní členové týmu jsou v karanténě, jejich tělo by totiž mohlo být také nakaženo neznámým virem. Mezitím se mimozemský organismus rozrůstá i do ostatních pater směrem k hlavní energetické síti...
Carson Beckett vynalezne virus Phage, který má zničit Wreithský patogen, jímž byla nakažena doktorka Kellerová. O 300 let později je virus se stejným názvem objeven v delta kvadrantu naší galaxie, tentokrát v seriálu Star Trek Voyager (s01e05). Zde způsobuje degradaci genetického kódu rasy Vidiianů. Za zmínku možná stojí i to, že Robert Picardo, který hrál Doktora, jenž se s virem v sérii Star Trek potýkal, hrál zároveň i Richarda Woolseyho, který jako vedoucí expedice Atlantis stál u zrodu této nemoci.