Gibbsův tým je dopraven helikoptérou na loď USNS Chimera - přísně utajovanou 'oficiálně neexistující' námořní loď. Mají vyšetřit smrt nadporučíka Satoshi Takady, který se účastnil tajných pokusů s nebezpečnými viry. Na lodi se však nenachází nikdo z posádky. Dr. Mallard zjistí, že se Satoshi nakazil smrtícím virem přenášeným vzduchem. Jak však došlo k úniku viru z nejmodernější laboratoře? A kam se poděla posádka?
Pozor následuje podrobný obsah včetně spoilerů
Šestý díl seriálu začíná v lodní jídelně. Jednomu z námořníků se udělá nevolno a za pár minut umírá. K případu je povolán vyšetřovací tým NCIS, který má začít vyšetřování na lodi. Když však dorazí na místo činu, na palubě nikoho nenajdou. Na lodi chybějí záchranné čluny - všechno nasvědčuje tomu, že byla velmi rychle opuštěna, dokonce bez toho aby vyslali třeba i jen S.O.S.
Při pátrací akci objeví McGee velmi dobře vybavenou laboratoř, podle všeho ji využívali na zkoumání potkanů. Tony, Ziva a McGee objeví krvavé stopy které je dovedou k mrazícímu boxu, ve kterém najdou tělo mrtvého námořníka. Zjistí, že zemřel v důsledku virové hemoragické horečky, které byla vystavena celá posádka.
Gibbsovi je jasné, že nemůžou opustit loď. No Ducky poznamená, že to je jejich nejmenší problém. Pokud je jeho diagnóza správná, do rána budou mrtvi...
(Gibbs, Tony, Ziva a McGee zůstali na opuštěné lodi.) Abby: Jste v pořádku? McGee: Ano, jsme v pohodě. Já bojuji s fobií z lodě. Tony s fobií z potkanů a Ziva s fobií z duchů. Abby: No, a s čím bojuje Gibbs? Gibbs: S nimi.