Poté, co se Avocet v čele s Grandersonovou zmocnil lodi, drží posádku jako rukojmí. Jednomu členu posádky se však povede utéct. Záchrana ostatních je teď v jeho rukou. Na můstku mezitím probíhají snahy o záchranu života Quincyho. Ten je postřelený, ale jako jeden z mála ví, kde je původní vzorek vakcíny. Na souši mezitím operuje několik pozemních týmů lodi USS Nathan James. Kapitán Chandler se snaží dostat rodinu do bezpečí a s pomocí ostatních převzít kontrolu na lodi. Jedinou cestou se zdá být spalovna. Když se k němu navíc přidají místní povstalci v čele s neohroženým Thorwaldem a vládcem podzemního města, má operace opět o trochu větší naději na úspěch. Doktorka Scottová se snaží zachránit nemocné, a doktor Hamada i nadále zkouší vyvinout vakcínu na vlastní pěst. Když se ale nedaří najít původní vzorek, zbývá jediná možnost. Využít buněk plodu někoho, kdo má v těl vakcínu. A na palubě USS Nathan James někdo těhotný je.