Kapitán Rex a jeho tým je smrtelně vyslán splnit poslední část celého úkolu. Ta je ovšem ještě těžší než úkol minulý. Tentokrát mají kloni, pod velením mistra Krella, zaútočit proti opevněnému městu. Proti klonům vyrazí opravdu mnoho bitevních sil, proto musí vymyslet nový plán, o kterém Mistr Krell neví.