Dvě maličké rakve obsahují mumie dvou dívek, testem DNA potvrzuje téměř jistě jeho dcery, nikoliv oběti. Pravděpodobnou příčinou smrti je krvesmilstvo, protože jejich matka, jeho královna, byla pravděpodobně jeho vlastní sestra, stejně jako jeho otec. Achenathonova manželka a jeho matka byla pravděpodobně také sestra. Tato incestní praktika „zachování královské krve“ pravděpodobně také odpovídá za jeho vlastní bolestné vady, doložené různými důkazy z pokladu, jako jsou sandály na míru a vycházkové hole. Přesto oslabení impéria během náboženské revoluce jeho otce oslabilo impérium a přinutilo ho, aby znovu získal status egyptské supervelmoci válkou. Klidně tak mohl být zabit na bitevním poli...